iPhoneやiPod touchでは、通常Flashビデオ(FLVファイル)を見ることはできませんが、それを何とかするブックマークレット「iTransmogrify」が登場しています。
「iTransmogrify」は、ソースコードをブックマークとして登録しておくことで機能を呼び出すことができる“ブックマークレット”という形で提供されています。
使い方は、iPhone、iPod touchに搭載されているモバイル版のSafariでネットサーフしている時に、FLV形式のビデオが埋込まれたページを表示した状態で、登録済みの「iTransmogrifyブックマークレットを」呼び出すと、下記のように再生マークのついた“YouTubeアプリ”のアイコンが表示されます。

そして、それをタップすれば、iPhoneやiPod touchに搭載された“YouTubeアプリ”で変換済みの動画が再生されるという仕組みです。
少し手間はかかってしまいますが、見れないよりはずっと良いです。
下記は動作している様子の動画です。
ブックマークレットの入手は下記ページにて可能です。
・itransmogrify - Google Code
上記ページで、下記の画像で赤色でマーキングした部分のリンクを、iPhoneやiPod touchでブックマークすればOKです。

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